第?選択薬は昔からアムフォテリシンBと5-FCですが、副作用として腎障害が有名です。腎機能障害があまりに強い場合は、ジフルカンを使用してください。
第一選択
アムビゾーム点滴静注用50mg 【大日本住友製薬】(liposomal amphotericin B; L-AMB）
1日1回3 to 4mg/kgをゆっくり点滴静注（投与方法はしっかりと添付文章を確認ください）
効果が乏しい場合は、6mg/kgまで増量可能
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アンコチル（フルシトシン: 5-FC） 25mg/kg/回 1日4回経口
アンビゾーム以外には、以前は以下の製剤も使用されていました。
アムホテリシンB（ファンギゾン; d-AMPH; アムホテリシンBデオキシコール酸（d-AMPH））１日１回 0.25mg/kg 6時間でゆっくり点滴静注 翌日より0.5-1.0mg/kgへ漸増。必ず500ml以上の5％ブドウ糖に溶解してください。
第二選択
ジフルカン 400mg/日 1日1回経口、経口不可能なら静注
その他
イトリゾール（イトラコナゾール） 200mg/日 1日１回 食直後経口
ブイフェンド（ボリコナゾール） 初回のみ12mg/kg/日分２、翌日より6-8mg/kg/日分２でゆっくり点滴静注。状態が落ち着いていれば、1週間を目安に経口400-600mg/日分２への切り替えを考慮する
クリプトコッカス髄膜脳炎の場合、臨床症状が改善し、髄液のクリプトコッカス抗原が陰性化したら、ジフルカンの内服に切り替え、比較的長期間使用します
